由于二级结构或者其它内在因素的影响，复杂结构对于测序是巨大的挑战。常规的测序方案往往容易出现提前中断或者测序结果紊乱的现象。

以下几种序列特点的样品适合针对复杂结构的测序方案：

高GC含量：GC含量>60%的模板，或者局部高GC含量的模板

发夹结构：包含两个反向重复序列，两个重复序列之间间隔至少3个碱基

重复序列：2个或3个碱基的多个连续重复。

DNA发卡结构及RNAi 模板测序

RNA干扰（RNAi）是指双链RNA（dsRNA）介导的特异性抑制某相关基因表达的一种机制。它逐渐发展为一种研究基因功能的快速有效的新兴技术。

RNAi模板，由于其存在 “发卡结构”，给测序工作带来了很大挑战。在RNAi研究中采用的小发卡RNA（shRNA）通常无法测序成功，测序结果往往提前中断或者信号紊乱。强耀生物拥有专门针对shRNA模板的测序方案，测序结果得到客户的一致认可。

强耀生物的测序方案可以对环状基因组的噬菌体（噬菌体上清或者噬菌斑）直接测序。当难以获得足够量的测序用噬菌体DNA样品时，该操作为您省掉DNA制备的繁琐过程，并能获得高质量的测序结果。

本项服务包括:

·节约时间和成本-无需菌液培养和DNA制备

·ABI3730xl DNA序列分析仪进行序列分析

·Phred20有效长度大于600bp

·免费提供强耀生物通用引物

·您可以选择在线提交订单，强耀生物CLIMS系统将长期保存您的订单信息以及测序结果:

·强耀生物的技术支持会针对项目中的问题及时与您沟通

强耀生物可以通过Primer Walking测序，帮助您获得未知克隆的序列信息，或者验证克隆序列的准确性。如果您提供参考序列，我们可以一次完成长片段克隆的全长测序。

本项服务包括:

·引物设计并合成

·根据序列图谱进行人工编辑

·序列拼接

·发送拼接序列结果